Uno de los movimientos más importantes fue el de Valparaíso (Zacatecas), 19 cuando, el 14 de agosto de 1926, por la noche apareció Don Pedro Quintanar, un personaje de gran importancia en toda la lucha cristera. El levantamiento que Aurelio Acevedo y sus amigos habían preparado desde el 1 de agosto fue preparado, ya que el Gobierno, al conocer la presencia de Quintanar, avanzó más rápido. La movilización se llevó a cabo en Peñitas y Peñas Blancas. Quintanar entró en combate el 29 de agosto a Huejuquilla el Alto (Jalisco), 20 así comenzó, la primera pelea cristera en forma, permaneciendo como vencedores con el ahora triunfante grito de: ¡Viva Cristo Rey!
Los levantamientos continuaron en Jalisco, Nayarit, Zacatecas, Guanajuato y Michoacán en 1926, luego se agregó casi todo el centro del país. El conflicto tenía un carácter fundamentalmente rural, aunque la dirección de la Liga era eminentemente urbana. Los cálculos más optimistas consideran que para 1927, las fuerzas de las cristeras eran alrededor de 12,000 tropas y dos años más tarde, en 1929, habían alcanzado 20,000. Vale la pena considerar tales números por varias razones. En primer lugar, los obispos mexicanos, con muy pocas excepciones, se distanciaron rápidamente del movimiento armado, ignoraron a la Liga e intentaron negociar la paz con el gobierno de Calles a través de la mediación del gobierno de los Estados Unidos.
En segundo lugar, porque México acababa de superar un conflicto armado prolongado y muy costoso que sangró durante poco más de siete años en una buena parte del país. No solo eso, los cristeros eran un ejército irregular (aunque tenían algunos soldados de carrera en sus filas), que no esperaban recibir el pago y no tenían mecanismos formales para aprovisionar, reclutar, entrenar, cuidar a sus heridos o tener cuidado con los desconsolado. A diferencia de otros grupos armados en la historia de México, no practicaron la llamada 'cámara' (una práctica por la cual las personas se ven obligadas a unirse a un ejército).
Citando experiencias sobre personas que vivieron la guerra en carne propia, dicen que muchos documentos de la iglesia fueron quemados, incluida la fe del bautismo de todas las personas. Finalmente, a diferencia de muchos grupos armados durante la revolución y antes, durante el siglo XIX, el mercado de armas de EE. UU. Estaba cerrado, al menos formalmente.
En 1928, después de una reforma de la Constitución de 1917 y a pesar de que la Revolución mexicana había comenzado a gritar "sufragio efectivo, no reelección", el ex presidente Álvaro Obregón se presentó como un candidato prácticamente único en las elecciones presidenciales. Se pensaba que el Grupo Sonora repetiría la fórmula seguida 40 años antes por el grupo Oaxaca, encabezado por Porfirio Díaz, para reformar gradualmente la Constitución. Sin embargo, se dijo que Obregón, a diferencia de Calles, no tenía interés en continuar el conflicto, por lo que llegaría a un acuerdo para poner fin a la guerra. Sin embargo, Obregón fue asesinado por el católico José de León Toral en el restaurante "La Bombilla" en la Ciudad de México. Obregón había venido allí para participar en un desayuno ofrecido por los legisladores del bloque parlamentario que lo apoyaba.